ICM-Pro v3.4-8

Вы здесь

Просмотров:
0

Химики заберай)))
Простая и законченная среда настольного моделирования для биолога или химика, заинтересованного молекулярной структурой и функцией.
ICM enpowers биолог или химик с освещающими и высококачественными диалоговыми 3-ьими обозрениями с быстрым доступом к полной sturctural базе данных. Только в несколько секунд Вы можете просмотреть сотни структур интереса, загружают их, анализируют и визуализируют последовательности, структуры, выравнивания, сайты, карманы изучения и связанные лиганды и наркотики(лекарства), поверхности изучения, мутации, карманы, сохранения последовательности.

 


Специальная компактная форма PDB (xpdb-миниЭВМ) разработана(предназначена) и свободно распределена, чтобы достигнуть высокой скорости доступа. ICM поддерживает многократные входные форматы. Вы можете искать структурную базу данных областью(полем), последовательность копирует и получает диалоговую таблицу для мгновенного рассмотрения.
ICM предлагает богатую графическую среду и мощные обозрения для профессионального качества изображений и молекулярных видео мультипликации. ICM поддерживает два вида стерео, включая высококачественный "в-окне" режим, так же как режим стерео, который не требует никаких специальных аппаратных средств. Самые новые особенности графического интерфейса пользователя включают:
главное представление(вид) с многократными молекулярными объектами(целями), 3-ьими петлями, последовательностями, выравниваниями
непосредственная связь/cross-selection между 3-ьими объектами(целями), последовательностями и выравниваниями
выборы на любом уровне и в главном представлении(виде), представлении(виде) последовательности, выравнивание рассматривает и графическое представление(вид)
выборы на вторичном уровне структуры
динамические всплывающие меню для молекул, остатков, 3-ьих петель, последовательностей, выравниваний, карт, и выборов
перетащите: понизите(пропустите) молекулу от главного представления(вида) до графического экрана, и это будет отображено
диалоговый браузер таблицы результата и диалоговые графики, подключающие 3-ий графический, главное представление(вид) и отчеты(рекорды) таблицы (см. вышеупомянутое ICM представление(вид) человеческих хромосом).
Встроенный молекулярный редактор позволяет тянуть(рисовать) состав и немедленно конвертировать(преобразовывать) это в живой 3-ий объект(цель).
ICM программный проект был первоначально desinged вокруг нового молекулярного подхода механики и алгоритма оптимизации для для предсказания пептида, моделирования соответствия, моделирований петли, гибкой макромолекулярной стыковки(постановки в док) и обработки, и затем был расширен(продлен) на графические, молекулярные мультипликации, химию, анализ последовательности, исследования базы данных, математику, статистику и составление графика.
Electrostatics: уравнение Пуассона для молекулы любого размера может быть эффективно решено, используя граничный алгоритм элемента, который не зависит ни от какой сетки, и использует точную аналитическую молекулярную поверхность как граница.
Вычисляет точный электростатический потенциал молекулы, используя граничный алгоритм элемента и производит 3-ью поверхностную модель кожи, цветную потенциалом. Решает уравнение Пуассона для молекулы с точными позициями электрических нагрузок. Этот метод быстрый и точный. Энергия расчетный состоит из внутримолекулярной энергии и энергии сольватации, которая может быть проанализирована отдельно. Оценивает межмолекулярную сольватацию электростатическая энергия взаимодействия.

ICM enpowers a biologist or chemist with a lighting fast access and high quality interactive 3D views to the entire sturctural database. In just a few seconds you can browse hundreds of structures of interest load them, analyze and visualize sequences, structures, alignments, sites, study pockets and bound ligands and drugs, study surfaces, mutations, pockets, sequence conservations.
A special compact form of PDB (xpdb-mini) is designed and is freely distributed to reach the high speed of access. ICM supports multiple input formats. You can search structural database by field, sequence pattern and get an interactive table for instant viewing.
ICM offers a rich graphical environment and powerful views for professional quality of images and molecular animation videos. ICM supports two kinds of stereo, including a high quality "in-window" mode, as well as a stereo mode which does not require any special hardware. The newest features of the graphics user interface include:
Windows XP/NT/2000, Linux/i386/AMD64